НАШИ
ТЕХНОЛОГИИ
Отправить заявку
Copyright © 2021. Все права на материалы сайта принадлежат компании ЗАО «БИОКАД».
Официальный сайт: www.biocad.ru
Для разработки лекарственных препаратов BIOCAD применяет технологию structure-based drug design, использующую методы компьютерного моделирования. Это позволяет сделать поиск молекул направленным.
С помощью математического моделирования отобранная молекула оптимизируется под конкретную мишень, а затем воспроизводится
в реальной лаборатории.
В основе большинства разработок компании лежит математическое моделирование. То, что раньше было возможно осуществить исключительно in vitro в стенах лабораторий, по мнению исследователей BIOCAD, сегодня может быть воплощено in silico силой чистого разума
НАШИ
ПРОЕКТЫ

Примите участие в проектах
вычислительной лаборатории
компании BIOCAD

FEP
Направление связано с точным вычислением свободной энергии
  • Улучшение семплирования для описания энергетического профиля биологической системы
  • Разработка эффективных GPGPU реализаций интеграторов, термостатов и баростатов
  • Разработка GPGPU реализации алхимического протокола превращения.
  • Разработка инструментов на основе алхимического протокола
FOLD
Направление связано с задачами
сворачивания белков
  • Улучшение GPGPU реализации методов локальной оптимизации энергии для полноатомной модели OPLS + GBSA
  • Построение вероятностной крупнозернистой модели сворачивания основного каркаса белка
  • Подбор параметров модели с применением больших данных
MOLGEN
Направление связано с направленной генерацией малых молекул с заданными свойствами
  • Разработка метода генерации начальных приближений молекулярных графов по пространственной структуре белка
  • Разработка методов кодирования и декодирования молекулярных графов
  • Разработка методов управляемой генерации на основе вычислительных оценок параметров малых молекул
PKPD
Направление связано с задачами построения динамических моделей распространения препарата в организме и его воздействия
на организм
  • Разработка методов переноса экспериментальных данных на животные или человеческие модели.
  • Разработка методов создания популяционных моделей.
  • Создание моделей иммунных синапсов для описания эффектов применения иммуноонкологических препаратов.
DOCK
Направление связано с задачами поиска места белок-белковых взаимодействий
  • Улучшение GPGPU реализации методов локальной оптимизации энергии для полноатомной модели OPLS + GBSA. (смежная с FOLD)
  • Построение статистического попарного потенциала для решения задачи жетской состыковки белков.
  • Поиск альтернативного метода состыковки белков, не использующего поиск корреляции сеток.
  • Разработка метода классификации состыковки (отличить белки, которые будут стыковаться от тех, что не будут).
  • Разработка метода классификации подвижности белковых цепей.